Porto Rico est un territoire non incorporé des États-Unis. Les conditions d'entrée y découlent du droit fédéral américain, sans règle locale particulière. Un voyageur venu de France, de Belgique ou de Suisse prépare donc ses papiers comme pour un séjour en Floride ou à New York.
Le contrôle des personnes relève des autorités fédérales et non du gouvernement de Porto Rico. Les motifs d'admission, la durée de séjour et les causes de refus restent identiques à ceux du reste des États-Unis. Un vol arrivant du continent américain compte comme un vol intérieur et ne donne lieu à aucun nouveau contrôle d'immigration à San Juan.
La France, la Belgique et la Suisse participent au programme d'exemption de visa. Leurs ressortissants obtiennent une autorisation électronique ESTA avant le départ, sur le site officiel du département de la sécurité intérieure. Cette demande est payante et son tarif a été relevé récemment, ce qui rend utile une vérification du montant au moment de la démarche. L'autorisation couvre plusieurs entrées pendant sa période de validité et ne remplace jamais la décision de l'officier de contrôle.
Le programme d'exemption de visa suppose un passeport électronique à puce, valable pendant toute la durée du séjour. Certaines situations personnelles font perdre le bénéfice de l'exemption et obligent à déposer une demande de visa auprès du consulat des États-Unis.
Le passage par une escale américaine implique de récupérer les bagages, de franchir l'immigration puis la douane, et de réenregistrer les valises avant le vol vers San Juan. Une correspondance d'au moins 3 heures limite le risque de vol manqué. Les agents interrogent souvent le voyageur sur son adresse d'hébergement et sur son billet de retour.
L'exemption de visa ouvre droit à un séjour touristique ou d'affaires de 90 jours au maximum, sans travail rémunéré ni prolongation sur place. Un projet plus long relève d'un visa demandé avant le départ.
Les Canadiens échappent à l'ESTA et présentent simplement leur passeport à l'arrivée par voie aérienne. Leur durée de séjour admise dépasse habituellement celle des Européens, la décision finale appartenant au poste frontière.
Porto Rico appartient au territoire douanier des États-Unis et applique les mêmes franchises sur l'alcool, le tabac et les sommes en espèces. Les fruits, les plantes et les produits carnés font l'objet de restrictions strictes, et une inspection agricole a lieu au départ de l'île vers le continent. L'arrivée d'un chien ou d'un chat suppose un certificat vétérinaire récent et une vaccination antirabique à jour.